化学には、標準の LaTeX にはない 3 つの道具が要ります——化学式・反応式（mhchem の \ce）、構造式の作図（chemfig）、そして 総合的な化学ツールキット（chemmacros：命名法・酸化数・単位…）。このページはこの 3 つを扱います。
化学式・反応式 — mhchem の \ce
\usepackage{mhchem} を読み込み、化学はすべて \ce{...} の中に書きます。数字は自動で下付きになり（\ce{H2O} → H₂O）、元素のあとの +／- は電荷の上付きに（\ce{SO4^2-}）、->／<=> は反応・平衡の矢印になります（矢印には角括弧でラベルを、(aq) などの状態も付けられます）。本文中でも別行でも、化学を最も手軽に組めます。
latex
\usepackage{mhchem}
...
\ce{2 H2 + O2 -> 2 H2O} % 反応式 / a reaction
\ce{SO4^2-} % イオンと電荷 / ion with charge
\ce{CaCO3 ->[\Delta] CaO + CO2} % 矢印にラベル / labeled arrow構造式を描く — chemfig
chemfig（Christian Tellechea 作）は、骨格構造式 を \chemfig{...} で描きます。結合は -（単）=（二重）~（三重）、角度は 0〜7 の番号（45°刻み）や [:絶対角]／[::相対角]、枝は括弧で、環は *6(...) のように指定します。TikZ に基づきます。
latex
\usepackage{chemfig}
...
\chemfig{H-C(-[2]H)(-[6]H)-H} % メタン / methane
\chemfig{*6(-=-=-=)} % ベンゼン環 / benzene ring総合ツールキット — chemmacros
本格的な化学組版には chemmacros（Clemens Niederberger 作）。命名法、酸化数、酸化還元、ニューマン投影、熱力学、単位など、多数のモジュールを備えた総合バンドルです。内部では chemformula（mhchem に似た \ch{...} で化学式を組む）や chemgreek・ghsystem を使います。化学式と構造式以上のものが必要なときに頼れます。